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Además de la prueba de ácido nucleico para COVID-19, ¿qué más puede hacer un laboratorio de PCR?
2022-10-14

El laboratorio de PCR también se conoce como laboratorio de amplificación génica. La tecnología de PCR cuantitativa en tiempo real con fluorescencia es un gran salto en la tecnología de cuantificación de ADN, se utiliza para amplificar fragmentos específicos de ADN y puede considerarse como una replicación especial de ADN fuera del organismo.

A través del sistema de rastreo genético de ADN, se puede conocer rápidamente la carga viral en el paciente, con una precisión de hasta el nivel nanométrico. Y la PCR cuantitativa en tiempo real con fluorescencia es el vehículo para lograr esta tecnología.El laboratorio de PCR se utiliza habitualmente para detectar enfermedades infecciosas virales como el SIDA, la hepatitis B, la gripe aviar, etc., mediante la amplificación de los genes contenidos en el virus, se detecta si los infectados con baja carga viral portan virus específicos.El método de detección por PCR presenta ventajas como alta sensibilidad, alta especificidad, rapidez y bajos requisitos para las muestras, por lo que es ampliamente reconocido por los médicos clínicos y se ha aplicado extensamente en el diagnóstico clínico hospitalario y en el diagnóstico de gripe aviar en los diversos departamentos de inspección epidemiológica.

Impulsados por las políticas nacionales y el desarrollo de la epidemia, los hospitales de todos los niveles en diversas regiones han comenzado o están preparando la creación de laboratorios de PCR independientes y conformes, y todas las instituciones médicas ya cuentan con capacidad de prueba de ácido nucleico. Sin embargo, debido a las diferencias en la epidemia entre regiones, algunos laboratorios de ácido nucleico en zonas de bajo riesgo a largo plazo se encuentran casi inactivos, aparte de su función de emergencia. Esta situación es también la mayor preocupación de los directivos de los hospitales de todos los niveles al establecer los laboratorios: han invertido fondos y esfuerzos, pero no pueden generar ingresos para el hospital.


En realidad, el laboratorio de PCR tiene funciones extremadamente potentes; el análisis cualitativo y la detección cuantitativa son sus dos mayores direcciones de aplicación. Entonces, además de la prueba de ácido nucleico para COVID-19, ¿qué más puede hacer nuestro laboratorio de PCR "todoterreno"? A continuación, se presentarán algunos ejemplos de proyectos en direcciones de aplicación concretas, con la esperanza de que estos ejemplos puedan ofrecer a los sistemas médicos de todos los niveles algunas ideas y orientaciones para el desarrollo de proyectos.


(I) Determinación de patógenos

La aparición de la tecnología de PCR permite realizar la detección de patógenos de forma rápida y conveniente. Debido a que la tasa de falsos positivos de la tecnología de PCR es demasiado alta, basta con que exista una cantidad mínima de patógenos para obtener un resultado positivo, lo cual no puede servir como base diagnóstica; solo cuando existe una determinada cantidad de patógenos tiene significado clínico. Por lo tanto, la cuantificación precisa de la plantilla resulta especialmente importante; la aplicación de la tecnología de PCR con fluorescencia permite obtener resultados de forma rápida y precisa. Para resolver el problema de la "ventana inmunológica" en la detección inmunológica, determinar si la enfermedad se encuentra en estado latente o subclínico, y cuando la detección de anticuerpos no puede determinar si se trata de una infección actual o pasada, se puede utilizar la PCR para confirmarlo.

Ejemplo:Prueba de ácido nucleico para el nuevo coronavirus.

Metodología:Método de PCR con fluorescencia.

Uso:Para la detección cualitativa in vitro de casos sospechosos de neumonía por infección del nuevo coronavirus, pacientes con casos sospechosos de conglomerados y otros que requieran diagnóstico o diferenciación de infección por el nuevo coronavirus.

Genes detectados: ORF1ab y gen N, gen E del nuevo coronavirus (2019-nCoV).

Tipos de muestras:Muestras de vías respiratorias superiores: hisopado faríngeo, hisopado nasal; muestras de vías respiratorias inferiores: aspirado respiratorio, muestra de lavado broncoalveolar, muestra de biopsia de tejido pulmonar.

Proceso de detección:

(1) Protección de bioseguridad antes de la prueba de ácido nucleico (colocación de protección personal de nivel tres del personal) → (2) Inactivación de la muestra (inactivación a 56 °C durante 30 minutos) → (3) Extracción de ácido nucleico de la muestra (manual, instrumento de extracción de ácido nucleico) → (4) Preparación del sistema de PCR y adición de la plantilla → (5) Detección en el equipo y análisis de resultados → (6) Desinfección después de la detección.

Detección de otros patógenos:VIH, hepatitis A, B y C, VPH, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, virus de Epstein-Barr, adenovirus, citomegalovirus, influenza A y B, virus del Ébola, estreptococo del grupo B.

Hospitales y departamentos adecuados para su implementación:Hospitales infantiles, de maternidad y salud maternoinfantil, institutos de examen pediátrico, laboratorios de terceros, hospitales de diversos niveles con demanda.


(II) Detección de enfermedades genéticas

Las mutaciones genéticas y las variaciones en el número de copias son la principal base genética de la aparición de enfermedades genéticas, y también son los principales objetivos de la detección de enfermedades genéticas. La complejidad de las enfermedades genéticas va acompañada de un gran número y una amplia variedad de tipos de mutaciones genéticas; las variaciones en el número de copias génicas no solo se manifiestan como deleciones y duplicaciones, sino que la posición, el tamaño de la deleción y el número de copias de la duplicación también presentan diversidad. La complejidad de las variaciones genéticas plantea desafíos técnicos para la detección clínica de enfermedades genéticas. La tecnología de PCR en tiempo real es una nueva generación de tecnología de PCR en tiempo real desarrollada recientemente por nosotros, que mediante marcaje fluorescente o análisis de punto de fusión puede detectar múltiples objetivos en un solo tubo de reacción.

Ejemplo:Detección de microdeleciones en la región AZF del cromosoma Y humano.

Metodología:Método de PCR con fluorescencia.

Uso:Este producto se utiliza para la detección cualitativa de la presencia de deleciones en la región del factor de azoospermia (azoospermia factor, AZF) del cromosoma Y en muestras de sangre total masculina; los sitios específicosde detección de deleciones son:AZFa: sY84, sY86; AZFb: sY127, sY134; AZFc: sY254, sY255; AZFd: sY145, sY152.

Los estudios clínicos demuestran que las deleciones en diversos grados de la región AZF del cromosoma Y (AZFa, AZFb, AZFc, AZFd) pueden provocar en los hombres oligozoospermia, azoospermia o teratozoospermia, lo que conduce a la infertilidad masculina. Este kit puede auxiliar en el diagnóstico y confirmación del análisis etiológico de pacientes con infertilidad, los resultados de la detección son solo para referencia clínica y no pueden utilizarse de forma aislada como base para el diagnóstico clínico definitivo o la exclusión de casos.

Tipos de muestras:Sangre total.

Proceso de detección:

(1) Procesamiento de la muestra y extracción de ADN (realizado en el área de preparación de muestras) → (2) Procesamiento de la muestra y extracción de ADN (realizado en el área de preparación de muestras) → (3) Carga de la muestra (realizado en el área de preparación de muestras) → (4) Amplificación por PCR (realizado en el área de amplificación) → (5) Análisis e interpretación de los resultados.

Otros proyectos similares:Talasemia, sordera, fenilcetonuria (PKU), favismo (G6PD), atrofia muscular espinal (SMA), distrofia muscular progresiva (DMD), espondilitis anquilosante (HLA), hemofilia.

Hospitales y departamentos adecuados para su implementación:Hospitales materno-infantiles, laboratorios independientes, hospitales de diversos niveles con necesidad.


(III) Farmacogenómica personalizada

El desarrollo de la farmacología y la farmacogenómica ha esclarecido la esencia genética de las diferencias individuales en el metabolismo y los efectos de los fármacos. Las reacciones farmacológicas anómalas se deben principalmente a variaciones en los genes de las enzimas metabolizadoras de fármacos que provocan una actividad enzimática anormal, lo que a su vez impide que el fármaco sea metabolizado y eliminado normalmente del organismo tras su administración, haciendo que la concentración del fármaco en el organismo sea demasiado alta o demasiado baja, sin alcanzar el efecto terapéutico ideal. Este tipo de reacción farmacológica anómala puede abordarse mediante la detección de los genes relacionados con el fármaco que toma el paciente, ajustando la dosis o buscando fármacos alternativos, para elaborar en la mayor medida posible un régimen de tratamiento farmacológico más razonable, eficaz y económico.

Ejemplo:Detección guiada de farmacogenómica cardiovascular personalizada: kit de detección de mutaciones del gen CYP2C19, kit de detección de mutaciones del gen CYP2C9, kit de detección de mutaciones del gen ALDH2, kit de detección de mutaciones del gen MTHFR.

Metodología:Método de PCR con fluorescencia.

Uso:El clopidogrel, la warfarina, la nitroglicerina y el ácido fólico son fármacos comunes en la práctica clínica cardiovascular. La detección molecular en biología de la guía de medicación cardiovascular permite determinar el genotipo; los farmacéuticos clínicos del servicio de farmacia, basándose en los resultados de la detección y considerando de forma integral los factores propios del paciente, el diagnóstico clínico y la información relacionada con la medicación combinada, emiten recomendaciones de medicación personalizada para la práctica clínica.

Tipos de muestras:Sangre total (este kit no requiere extracción de ADN, se realiza PCR directa con la muestra).

Proceso de detección:

(1) Preparación del sistema de reacción (realizado en el área de preparación de reactivos) → (2) Adición directa de sangre total (realizado en el área de preparación de muestras) → (3) Amplificación por PCR (realizado en el área de amplificación) → (4) Análisis e interpretación de los resultados.

Otros proyectos similares:Medicación con estatinas (ApoE), betabloqueantes (ADRB1), medicación segura en niños, farmacogenómica personalizada para quimioterapia dirigida oncológica (EGFR, kRAS) y similares.

Hospitales y departamentos adecuados para su implementación:Hospitales cardiovasculares, hospitales oncológicos, laboratorios independientes, hospitales de diversos niveles con necesidad.


(IV) Investigación oncológica

El cáncer es una enfermedad que pone en peligro la salud humana; su grado de malignidad y el pronóstico dependen principalmente de la presencia de metástasis y de la estadificación del corte histopatológico. Con el rápido desarrollo de la biología molecular, numerosos resultados de investigación en el campo de la oncología muestran que la aparición, el desarrollo, el tratamiento y el pronóstico del cáncer están relacionados con los genes internos de las células tumorales y con los virus asociados a tumores. La detección de la expresión de muchos protooncogenes y genes supresores de tumores puede revelar la posibilidad de carcinogénesis, y la metodología de PCR puede resolver este tipo de cuestiones. Además, el método de PCR se utiliza para la detección cualitativa in vitro de la metilación del gen septin9 en plasma de sangre periférica humana, para el diagnóstico auxiliar clínico de diversos tumores.

Tipos de muestras:Sangre total/tejido.

Proceso de detección:

(1) Construcción del sistema de reacción de PCR (realizado en el área de preparación de reactivos) (2) Procesamiento de la muestra y extracción de ADN (realizado en el área de preparación de muestras) → (3) Conversión con bisulfito (realizado en el área de preparación de muestras) → (4) Amplificación por PCR (realizado en el área de amplificación) → (5) Análisis e interpretación de los resultados.

Otros proyectos similares:Gen SHOX2, gen RASSF1A, metilación del gen SDC2, metilación del gen MGMT, RNF180, her2.

Hospitales y departamentos adecuados para su implementación:Hospitales oncológicos, laboratorios independientes, hospitales de diversos niveles con necesidad.


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